色彩的调配过程是非常重要的，一般，我们可以先用冷灰色或暖灰色把画面的明暗调子画出来，然后在临摹实际的颜色，可以适当的夸张，突出主题，上色的时候先上浅色后上深色，因为马克笔不具有较强的覆盖性，浅色不易覆盖深色另外，马克笔应与彩色铅笔水彩等工具相结合，以弥补马克笔绘画时的不足。

马克笔可以调色可以利用色彩重叠画法，由于马克笔用的是透明水色，在画颜色时从色彩的明度上讲应先画最浅的颜色，然后再依次画较深的颜色，用暗色覆盖亮色，同时由于透明水色的`特性，当两种颜色重叠也就相当与两种颜色调配，会产生另一色相关系如红与蓝重叠会呈现紫色，黄与蓝重叠会呈现绿色等马克。

马克笔的上色步骤 用马克笔上色涂的满而均匀的方法1先用冷灰色或暖灰色的马克笔将图中基本的明暗调子画出来2在运笔过程中，用笔的遍数不宜过多在第一遍颜色干透后，再进行第二遍上色，而且要准确快速否则色彩会渗出而形成混浊之状，而没有了马克笔透明和干净的特点3用马克笔。